威库鲁文脑与疾病研究中心招募博士，癌症基因组学研究
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威库鲁文脑与疾病研究中心(VIB-KU Leuven Center for Brain & Disease Research)招募博士，癌症基因组学研究。
工作介绍
计算生物学实验室（www.aertslab.org）正在寻找一名博士生，以解读癌症中的基因调控过程。候选人需要设计新的人工智能模型来预测不同癌症细胞状态和不同肿瘤类型的基因表达情况。
这项研究需要将使用内部产生的和公开可用的单细胞数据集（例如，scRNA-seq，scATAC-seq）作为训练数据。应用不同的深度学习策略，包括卷积神经网络、transformers、变分自动编码器，以及它们的组合。另外还将研究如何制作一个 pan-cancer（泛癌症）的模型库。
根据申请者的学习背景和兴趣，与 wet-lab 紧密合作，以获得新的数据集，并通过实验验证之前的预测。此外，还将与实验室的同事合作使用该模型，以获得对癌细胞状态的机械洞察力，因此这些模型的可解释性（XAI）是至关重要的。该模型的其他应用将是对基因组 DNA 变异的解释，与空间全能数据的整合，以及作为新的治疗策略的设计的一部分。
任职要求
有人工智能、生物信息学、计算机科学、物理学、工程学、生物工程等领域的硕士学位，或同等学历
精通Python编程
有机器学习经验者优先（例如，Tensorflow/Keras/PyTorch）
有可解释人工智能（如SHAP）的经验者优先
有高性能计算、软件容器方面的经验
有癌症基因组学经验者优先，但并非绝对必要
有独立工作和团队合作的能力职位诱惑
可以使用最先进的 compute 和 GPU 基础设施
国际研究环境
可以成为跨越比利时三所大学的新 EOS 联盟的推动者
有竞争力的工资和福利
全额资助的博士生奖学金，鼓励申请国家博士生奖学金（如FWO）
直通车
申请方式：通过 https://jobs.vib.be/j/49440/phd-student-deep-learning-for-cancer-genomics 在线申请
申请内容：详细的简历、两封推荐信和一封动机信
